Dies kann in Google Chrome deaktiviert werden. Gehen Sie zu Einstellungen und wählen Sie unten auf der Seite "Erweiterte Einstellungen anzeigen ...". Klicken Sie auf "Inhaltseinstellungen" und dann unter der Überschrift "Handler" auf "Handler verwalten". Ändern Sie unter "Aktive Protokollhandler" mailto in "Keine".
Gehen Sie dann in Mail.app und in Einstellungen -> Allgemein und stellen Sie sicher, dass "Standard-E-Mail-Reader" auf "Mail" gesetzt ist.
Theoretisch sollte es wie oben beschrieben funktionieren. Aber für mich war das nicht der Fall, also habe ich RCFefaultApps Prefpane verwendet, um den Handler für mailto zurück zu Mail.app (auf Snow Leopard) wiederherzustellen.