InnoDB-Tabelle SELECT gibt ERROR 2006 (HY000) zurück: MySQL-Server ist verschwunden (nach Stromausfall)

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Dieser Server ist eine virtuelle Maschine, auf der CentOS 6.0, MySQL 5.5.21 ausgeführt wird

Es gibt eine Datenbank mit dem Namen devSystem. Es gibt InnoDB-Tabellen. Das Ausführen der folgenden Befehle führt zu Fehlern ERROR 2006 (HY000): MySQL server has gone away. Ich habe InnoDB bisher nicht ausgiebig genutzt und habe diese Art von Problem noch nicht erlebt. Ich kann nur davon ausgehen, dass es spezifisch für InnoDB ist, da es nicht mit MyISAM aufgetaucht ist. Wie auch immer, die Befehle, die ich ausführen möchte, lauten wie folgt.

mysql -u root -p
mysql> USE `devSystem`;
-- database changed
mysql> SHOW TABLES;

Vollständiger Fehler, wie vom MySQL-Client zurückgegeben

ERROR 2006 (HY000): MySQL server has gone away
No connection. Trying to reconnect...
Connection id:    1
Current database: devSystem

ERROR 2006 (HY000): MySQL server has gone away
No connection. Trying to reconnect...
ERROR 2002 (HY000): Can't connect to local MySQL server through socket '/var/lib/mysql/mysql.sock' (111)
ERROR:
Can't connect to the server

Versuchen Sie nun, SELECT aus der Tabelle auszuwählen, basketsdie in vorhanden istdevSystem

mysql> select * from baskets\G
ERROR 2006 (HY000): MySQL server has gone away
No connection. Trying to reconnect...
Connection id:    1
Current database: devSystem

ERROR 2006 (HY000): MySQL server has gone away
No connection. Trying to reconnect...
ERROR 2002 (HY000): Can't connect to local MySQL server through socket '/var/lib/mysql/mysql.sock' (111)
ERROR:
Can't connect to the server

Zum Vergleich habe ich eine zweite Datenbank ausprobiert, die ebenfalls InnoDB-Tabellen auf demselben Server enthält

mysql> USE `testSystem`;
-- database changed
mysql> SHOW TABLES;

Dadurch werden die Tabellen korrekt ausgegeben. Aus diesem Grund vermute ich, dass es sich devSystemspeziell um ein Problem handelt .

Ich habe versucht, hier weiter zu suchen, aber andere ähnliche Fragen scheinen nicht zu helfen. Hat jemand Vorschläge / Ratschläge, die mir bei der Lösung dieses Problems helfen? Das hat bisher meinen ganzen Morgen verschwendet!

Aktuelle Optionen scheinen darin zu bestehen, die Datenbank zu entfernen und von vorne zu beginnen (dies wird jedoch einen erheblichen Arbeitsaufwand bedeuten. Ich habe ein fast aktuelles Datenbankdesign, jedoch keine Sicherung der bisher generierten Daten).

Update 1 Hinzufügen innodb_force_recovery = 6zu my.cnfkönnen SHOW TABLE STATUSerfolgreich auszuführen, die Werte von <= 5 noch in dem Fehler führen , wie oben gezeigt. Wenn dieses Flag SELECT * FROM basketsfunktioniert, weist der Fehler bei einer Tabelle jedoch immer noch auf, dass es sich um eine Tabelle handelt, die möglicherweise das Problem verursacht.

mysql> SELECT * FROM supplierOptionalExtras_relationships;
ERROR 2006 (HY000): MySQL server has gone away
No connection. Trying to reconnect...
Connection id:    1
Current database: devSystem

ERROR 2013 (HY000): Lost connection to MySQL server during query

FAZIT

Letztendlich kann ich nach mehrstündigem Durchsuchen von Wiederherstellungsdateien nur den Schluss ziehen, dass meine Daten verloren gegangen sind (wie RolandoMySQLDBA gesagt hatte). Um so weit wie möglich zu kommen, folgte ich dem Vorschlag von DTest zu den Percona Recovery Tools. Die Datenbeschädigung führte jedoch dazu, dass die Tools die Daten ibdata1für die jeweilige Tabelle nicht aus meiner Datei extrahieren konnten .

Am Ende habe ich die Antwort von RolandoMySQLDBA verwendet und Folgendes getan

  1. Befolgen Sie die Anweisungen hier /programming/3927690/howto-clean-a-mysql-innodb-storage-engine/4056261#4056261 ohne die abgestürzte Datenbank
  2. Wird verwendet innodb_force_recovery = 6, um alle nicht abgestürzten Tabellendaten aus der Datenbank mit der abgestürzten Tabelle abzurufen
  3. Fahren Sie MySQl herunter innodb_force_recovery = 6, entfernen Sie die ibdata / iblog-Dateien (wie im Link in Schritt 1 beschrieben).
  4. Startete MySQL und lud gedumpte Daten
  5. Fehlerhafte Tabelle aus Designdateien neu erstellt
  6. Manuell neu gefüllte Daten

Dies bedeutete natürlich einen vollständigen Datenverlust aus der betroffenen Tabelle, was ein Problem darstellt. Ich kann jedoch nur hoffen, dass das Hinzufügen innodb_file_per_tablebei der Datenwiederherstellung hilfreich ist, falls dies erneut auftritt. Ich beabsichtige, die Stromversorgung irgendwann zu unterbrechen, um zu versuchen, dies beim Test zu reproduzieren Datenbank.


Im Folgenden finden Sie weitere ausführliche Informationen aus den Protokollen.

my.cnf

Dies ist nur ein Entwicklungssystem, daher ist die my.cnf SEHR einfach, tatsächlich unverändert gegenüber der Standardeinstellung

[mysqld]
datadir=/var/lib/mysql
socket=/var/lib/mysql/mysql.sock
user=mysql
old_passwords=1
[mysqld_safe]
log-error=/var/log/mysqld.log
pid-file=/var/run/mysqld/mysqld.pid

MySQL-Protokolle vom Server werden gestartet, bevor die fehlgeschlagene Abfrage ausgeführt wird

120302 10:57:42 [Note] /usr/libexec/mysqld: Normal shutdown

120302 10:57:42 [Note] Event Scheduler: Purging the queue. 0 events
120302 10:57:42  InnoDB: Starting shutdown...
120302 10:57:42  InnoDB: Shutdown completed; log sequence number 285938465
120302 10:57:42 [Note] /usr/libexec/mysqld: Shutdown complete

120302 10:57:42 mysqld_safe mysqld from pid file /var/run/mysqld/mysqld.pid ended
120302 10:57:43 mysqld_safe Starting mysqld daemon with databases from /var/lib/mysql
120302 10:57:43 [Note] Plugin 'FEDERATED' is disabled.
120302 10:57:43 InnoDB: The InnoDB memory heap is disabled
120302 10:57:43 InnoDB: Mutexes and rw_locks use GCC atomic builtins
120302 10:57:43 InnoDB: Compressed tables use zlib 1.2.3
120302 10:57:43 InnoDB: Using Linux native AIO
120302 10:57:43 InnoDB: Initializing buffer pool, size = 128.0M
120302 10:57:43 InnoDB: Completed initialization of buffer pool
120302 10:57:43 InnoDB: highest supported file format is Barracuda.
120302 10:57:43  InnoDB: Waiting for the background threads to start
120302 10:57:44 InnoDB: 1.1.8 started; log sequence number 285938465
120302 10:57:44 [Note] Event Scheduler: Loaded 0 events
120302 10:57:44 [Note] /usr/libexec/mysqld: ready for connections.
Version: '5.5.15'  socket: '/var/lib/mysql/mysql.sock'  port: 3306  MySQL Community Server (GPL) by Remi

MySQL-Protokollzeilen nach fehlgeschlagener Abfrage

120302 10:58:39  InnoDB: Assertion failure in thread 140030446421760 in file btr0btr.c line 695
InnoDB: Failing assertion: (ibool)!!page_is_comp(buf_block_get_frame(block)) == dict_table_is_comp(index->table)
InnoDB: We intentionally generate a memory trap.
InnoDB: Submit a detailed bug report to http://bugs.mysql.com.
InnoDB: If you get repeated assertion failures or crashes, even
InnoDB: immediately after the mysqld startup, there may be
InnoDB: corruption in the InnoDB tablespace. Please refer to
InnoDB: http://dev.mysql.com/doc/refman/5.5/en/forcing-innodb-recovery.html
InnoDB: about forcing recovery.
120302 10:58:39 - mysqld got signal 6 ;
This could be because you hit a bug. It is also possible that this binary
or one of the libraries it was linked against is corrupt, improperly built,
or misconfigured. This error can also be caused by malfunctioning hardware.
We will try our best to scrape up some info that will hopefully help diagnose
the problem, but since we have already crashed, something is definitely wrong
and this may fail.

key_buffer_size=8388608
read_buffer_size=131072
max_used_connections=1
max_threads=151
thread_count=1
connection_count=1
It is possible that mysqld could use up to
key_buffer_size + (read_buffer_size + sort_buffer_size)*max_threads = 338483 K
bytes of memory
Hope that's ok; if not, decrease some variables in the equation.

Thread pointer: 0x30396e0
Attempting backtrace. You can use the following information to find out
where mysqld died. If you see no messages after this, something went
terribly wrong...
stack_bottom = 0x7f5b61043d98 thread_stack 0x40000
/usr/libexec/mysqld(my_print_stacktrace+0x33)[0x77b6e3]
/usr/libexec/mysqld(handle_segfault+0x465)[0x50fc35]
/lib64/libpthread.so.0[0x37a9e0f4c0]
/lib64/libc.so.6(gsignal+0x35)[0x37a9a329a5]
/lib64/libc.so.6(abort+0x175)[0x37a9a34185]
/usr/libexec/mysqld[0x82a4bb]
/usr/libexec/mysqld[0x82a60c]
/usr/libexec/mysqld[0x85d133]
/usr/libexec/mysqld[0x862207]
/usr/libexec/mysqld[0x7e37a3]
/usr/libexec/mysqld(_ZN7handler7ha_openEP5TABLEPKcii+0x3d)[0x66903d]
/usr/libexec/mysqld(_Z21open_table_from_shareP3THDP11TABLE_SHAREPKcjjjP5TABLEb+0x537)[0x5edf67]
/usr/libexec/mysqld(_Z10open_tableP3THDP10TABLE_LISTP11st_mem_rootP18Open_table_context+0xc33)[0x54d2d3]
/usr/libexec/mysqld(_Z11open_tablesP3THDPP10TABLE_LISTPjjP19Prelocking_strategy+0x683)[0x54e043]
/usr/libexec/mysqld(_Z30open_normal_and_derived_tablesP3THDP10TABLE_LISTj+0x4b)[0x54e61b]
/usr/libexec/mysqld(_Z18mysqld_list_fieldsP3THDP10TABLE_LISTPKc+0x23)[0x5c5623]
/usr/libexec/mysqld(_Z16dispatch_command19enum_server_commandP3THDPcj+0x174f)[0x581f2f]
/usr/libexec/mysqld(_Z24do_handle_one_connectionP3THD+0xd2)[0x60e9e2]
/usr/libexec/mysqld(handle_one_connection+0x50)[0x60eaf0]
/lib64/libpthread.so.0[0x37a9e077e1]
/lib64/libc.so.6(clone+0x6d)[0x37a9ae18ed]

Trying to get some variables.
Some pointers may be invalid and cause the dump to abort.
Query (0x7f5b50004c20): is an invalid pointer
Connection ID (thread ID): 2
Status: NOT_KILLED

The manual page at http://dev.mysql.com/doc/mysql/en/crashing.html contains
information that should help you find out what is causing the crash.
120302 10:58:39 mysqld_safe Number of processes running now: 0
120302 10:58:39 mysqld_safe mysqld restarted
120302 10:58:39 [Note] Plugin 'FEDERATED' is disabled.
120302 10:58:39 InnoDB: The InnoDB memory heap is disabled
120302 10:58:39 InnoDB: Mutexes and rw_locks use GCC atomic builtins
120302 10:58:39 InnoDB: Compressed tables use zlib 1.2.3
120302 10:58:39 InnoDB: Using Linux native AIO
120302 10:58:39 InnoDB: Initializing buffer pool, size = 128.0M
120302 10:58:39 InnoDB: Completed initialization of buffer pool
120302 10:58:39 InnoDB: highest supported file format is Barracuda.
120302 10:58:39  InnoDB: Waiting for the background threads to start
120302 10:58:40 InnoDB: 1.1.8 started; log sequence number 285938465
120302 10:58:40 [Note] Event Scheduler: Loaded 0 events
120302 10:58:40 [Note] /usr/libexec/mysqld: ready for connections.
Version: '5.5.15'  socket: '/var/lib/mysql/mysql.sock'  port: 3306  MySQL Community Server (GPL) by Remi
120302 10:58:47  InnoDB: Assertion failure in thread 140051237820160 in file btr0btr.c line 695
InnoDB: Failing assertion: (ibool)!!page_is_comp(buf_block_get_frame(block)) == dict_table_is_comp(index->table)
InnoDB: We intentionally generate a memory trap.
InnoDB: Submit a detailed bug report to http://bugs.mysql.com.
InnoDB: If you get repeated assertion failures or crashes, even
InnoDB: immediately after the mysqld startup, there may be
InnoDB: corruption in the InnoDB tablespace. Please refer to
InnoDB: http://dev.mysql.com/doc/refman/5.5/en/forcing-innodb-recovery.html
InnoDB: about forcing recovery.
120302 10:58:47 - mysqld got signal 6 ;
This could be because you hit a bug. It is also possible that this binary
or one of the libraries it was linked against is corrupt, improperly built,
or misconfigured. This error can also be caused by malfunctioning hardware.
We will try our best to scrape up some info that will hopefully help diagnose
the problem, but since we have already crashed, something is definitely wrong
and this may fail.

key_buffer_size=8388608
read_buffer_size=131072
max_used_connections=1
max_threads=151
thread_count=1
connection_count=1
It is possible that mysqld could use up to
key_buffer_size + (read_buffer_size + sort_buffer_size)*max_threads = 338483 K
bytes of memory
Hope that's ok; if not, decrease some variables in the equation.

Thread pointer: 0x231b6e0
Attempting backtrace. You can use the following information to find out
where mysqld died. If you see no messages after this, something went
terribly wrong...
stack_bottom = 0x7f603847cd98 thread_stack 0x40000
/usr/libexec/mysqld(my_print_stacktrace+0x33)[0x77b6e3]
/usr/libexec/mysqld(handle_segfault+0x465)[0x50fc35]
/lib64/libpthread.so.0[0x37a9e0f4c0]
/lib64/libc.so.6(gsignal+0x35)[0x37a9a329a5]
/lib64/libc.so.6(abort+0x175)[0x37a9a34185]
/usr/libexec/mysqld[0x82a4bb]
/usr/libexec/mysqld[0x82a60c]
/usr/libexec/mysqld[0x85d133]
/usr/libexec/mysqld[0x862207]
/usr/libexec/mysqld[0x7e37a3]
/usr/libexec/mysqld(_ZN7handler7ha_openEP5TABLEPKcii+0x3d)[0x66903d]
/usr/libexec/mysqld(_Z21open_table_from_shareP3THDP11TABLE_SHAREPKcjjjP5TABLEb+0x537)[0x5edf67]
/usr/libexec/mysqld(_Z10open_tableP3THDP10TABLE_LISTP11st_mem_rootP18Open_table_context+0xc33)[0x54d2d3]
/usr/libexec/mysqld(_Z11open_tablesP3THDPP10TABLE_LISTPjjP19Prelocking_strategy+0x683)[0x54e043]
/usr/libexec/mysqld(_Z30open_normal_and_derived_tablesP3THDP10TABLE_LISTj+0x4b)[0x54e61b]
/usr/libexec/mysqld(_Z18mysqld_list_fieldsP3THDP10TABLE_LISTPKc+0x23)[0x5c5623]
/usr/libexec/mysqld(_Z16dispatch_command19enum_server_commandP3THDPcj+0x174f)[0x581f2f]
/usr/libexec/mysqld(_Z24do_handle_one_connectionP3THD+0xd2)[0x60e9e2]
/usr/libexec/mysqld(handle_one_connection+0x50)[0x60eaf0]
/lib64/libpthread.so.0[0x37a9e077e1]
/lib64/libc.so.6(clone+0x6d)[0x37a9ae18ed]

Trying to get some variables.
Some pointers may be invalid and cause the dump to abort.
Query (0x7f6014004c20): is an invalid pointer
Connection ID (thread ID): 1
Status: NOT_KILLED

The manual page at http://dev.mysql.com/doc/mysql/en/crashing.html contains
information that should help you find out what is causing the crash.
120302 10:58:47 mysqld_safe Number of processes running now: 0
120302 10:58:47 mysqld_safe mysqld restarted
120302 10:58:47 [Note] Plugin 'FEDERATED' is disabled.
120302 10:58:47 InnoDB: The InnoDB memory heap is disabled
120302 10:58:47 InnoDB: Mutexes and rw_locks use GCC atomic builtins
120302 10:58:47 InnoDB: Compressed tables use zlib 1.2.3
120302 10:58:47 InnoDB: Using Linux native AIO
120302 10:58:47 InnoDB: Initializing buffer pool, size = 128.0M
120302 10:58:47 InnoDB: Completed initialization of buffer pool
120302 10:58:47 InnoDB: highest supported file format is Barracuda.
120302 10:58:47  InnoDB: Waiting for the background threads to start
120302 10:58:48 InnoDB: 1.1.8 started; log sequence number 285938465
120302 10:58:48 [Note] Event Scheduler: Loaded 0 events
120302 10:58:48 [Note] /usr/libexec/mysqld: ready for connections.
Version: '5.5.15'  socket: '/var/lib/mysql/mysql.sock'  port: 3306  MySQL Community Server (GPL) by Remi
Simon bei My School Portal
quelle

Antworten:

4

Das kommt mir merkwürdig bekannt vor.

Ich habe dies bei einem der DB-Server meines Webhosting-Clients gesehen. Es gab eine bestimmte Tabelle, die mysqld jedes Mal zum Absturz brachte, wenn Sie darauf zugegriffen haben, auch mit SHOW CREATE TABLE.

Das Problem ist auf ein beschädigtes Datenwörterbuch zurückzuführen. Es gibt wirklich keine Möglichkeit, dies zu korrigieren. Sie könnten versuchen, die tablespace_id in der .ibd-Datei zu ändern, aber die Kopfschmerzen entstehen durch das Auffinden der tabellenraum_id-Liste innerhalb von ibdata1.

Selbst wenn Sie eine MyISAM-Tabelle mit demselben Namen in derselben Datenbank wie die ursprüngliche InnoDB-Tabelle erstellen, können Sie sie nicht in InnoDB konvertieren, da die tablespace_id bereits dem Tabellennamen zugeordnet ist. Dies ist natürlich ein korrupter Zustand. Es ist, als hätte man ein Pidgeon-Loch in ibdata1, das man ohne eine explorative Operation nicht reparieren kann.

Möglicherweise müssen Sie alles außer der Datenbank, in der sich die beschädigte Tabelle befindet, mysqldump. Sie müssten dann jede Tabelle in dieser Datenbank mit Ausnahme der beschädigten Tabelle mysqldump. Denken Sie daran, dass die Ansicht des Datenwörterbuchs der Tabelle fehlerhaft ist, nicht unbedingt die Daten der Tabelle.

Die einzig sichere Möglichkeit, alles zu bereinigen, besteht darin, die soeben angegebenen mysqldumps auszuführen, mysql herunterzufahren, alle DB-Ordner außer / var / lib / mytsql / mysql rm -rf herunterzufahren, ibdata1 zu löschen, ib_logfile0 zu löschen, ib_logfile1 zu löschen, mysql zu starten, neu zu laden alle mysqldumps. Weitere Informationen zum Bereinigen Ihrer InnoDB-Infrastruktur finden Sie in meinem StackOverflow-Beitrag .

Da Sie innodb_file_per_table nicht verwenden, gehen Tabellen mit diesem beschädigten Status in ibdata1 als Gelegenheitsspiele verloren. Mein Beileid.

Klicken Sie hier, um eine künstlerische Konzeption von InnoDB und seinen Interna zu sehen .

RolandoMySQLDBA
quelle
innodb_file_per_table scheint an dieser Stelle eine sinnvolle Option zum Hinzufügen zu sein - ist dies ohne Neuerstellung realisierbar oder müssten alle Daten erneut importiert werden? In Bezug auf die oben genannte spezifische Frage werde ich bald die oben genannten Fragen durchgehen und sehen, wie es geht. Meine Sorge ist jedoch, dass die korrupte Tabelle diejenige ist, die mir am wichtigsten ist!
Simon bei My School Portal
Es hilft nicht bei den Metadaten in einem beschädigten Zustand.
RolandoMySQLDBA
2

Sie scheinen den schlimmsten Fall zu treffen: Ein beschädigter innodb-Tablespace ohne Backup, von dem wiederhergestellt werden kann (was wahrscheinlich viel schneller ist).

Percona bietet ein kostenloses Innodb-Wiederherstellungstool an. In diesem Blog erfahren Sie, wie Sie damit beschädigte Daten ohne Backup wiederherstellen können.

Es gibt diese sehr wichtige Einschränkung:

Die Zeit zwischen dem Löschen von Zeilen und dem Stoppen der Datenbank ist entscheidend. Wenn Seiten wiederverwendet werden, können Sie die Daten nicht wiederherstellen.

Leider werden Sie viel mehr Erfahrung mit der Reparatur beschädigter Innodb sammeln als ich persönlich jemals getan habe.

Derek Downey
quelle
1
Wenn von Anfang an nur innodb_file_per_table verwendet wurde. Dann hätte ich Simon hierher geschickt: chriscalender.com/?tag=innodb-error-tablespace-id-in-file . Derzeit ist das Percona Data Recovery Tool der letzte Ausweg. +1 für das Aufrufen dieses Tools.
RolandoMySQLDBA
inndob_file_per_table wird ab sofort verwendet. Haben die Struktur aus der Workbench-Datei zusammen mit gespeicherten Prozessen wiederhergestellt. usw. Sie müssen sich nur diese Antwort kurz ansehen, um zu versuchen, die Daten aus dieser letzten Tabelle wiederherzustellen.
Simon bei My School Portal
Richtig, ich komme damit irgendwohin. Bisher komme ich so weit, dass 3- Extract the rows jedoch ein Fehler zurückgegeben wird, Segmentation fault (core dumped)zusammen mit einem teilweisen (leider 1,5 Zeilen) Speicherauszug der Daten
Simon bei My School Portal
-1

hör auf mysql:

/etc/init.d/mysql stop

starte mysql_safe:

mysql_safe &

Holen Sie sich MySQL-Konsole wie immer:

mysql -u <user> -p bla bla bla or whatever

drop <conflicting-data-base>

kill mysql_safe

/etc/init.d/mysql start

und für mich behoben

jemand
quelle
-1 aus 4 Gründen: 1) Ihre Antwort macht ABSOLUT KEIN VERSUCH, Daten wiederherzustellen. 2) Das Töten von mysql_safe (oder ist das mysqld_safe) tötet mysqld nicht. Sie sind getrennte Prozesse. 3) Sie haben keine Sicherheitsmaßnahmen zum Wiederherstellen von Arbeitstabellen in die in Konflikt stehende Datenbank aufgenommen. Ein kleiner Aufwand würde Ihnen auch nur den geringsten Datenverlust ersparen. 4) Das Löschen der fehlerhaften Datenbank kann die InnoDB-Crash-Wiederherstellungsphase des MySQL-Starts zerstören. Sie sollten ausgeführt haben set global innodb_fast_shutdown = 0;, um Transaktionsprotokolle vollständig zu leeren und den Schreibpuffer während des normalen Herunterfahrens zu verdoppeln.
RolandoMySQLDBA