Sie müssen ein Modul nicht deaktivieren. Dies ist oft nicht einmal möglich, z. B. wenn viele andere Module darauf angewiesen sind und deren Deaktivierung Ihre Site beschädigen würde.
Möglicherweise möchten Sie Ihre Site während der Ausführung von Updates in den Wartungsmodus versetzen, da Ihre Site möglicherweise zwischen dem Ersetzen der Dateien und dem Ausführen von update.php vollständig unterbrochen wird.
Es wird jedoch empfohlen, zuerst die alten Dateien zu entfernen und dann das neue Verzeichnis hinzuzufügen. Der Grund dafür ist, dass Sie ansonsten veraltete Dateien erhalten, wenn Dateien verschoben oder gelöscht wurden.
Wenn Sie Shell-Zugriff haben, kann ich dringend empfehlen, für diese Aufgabe drush dl / up zu verwenden, da dies automatisch für Sie erledigt wird.