Raumanalyse und Clustering in der Nähe von Merkmalen

11

Ich arbeite am Markierungsverhalten bei lebenden Tieren in Gruppen und bin daran interessiert, wie das Markierungsverhalten von bestimmten Merkmalen der benachbarten Gruppen beeinflusst wird. Ich habe die Gebiete jeder Gruppe aus Isoplethen mit 95% Dichte aufgetragen, die mit a-LoCoH erstellt wurden. Die Markierungen jedes Individuums aus einer Gruppe werden als separate Punktebene dargestellt. Das Markierungsverhalten scheint nicht zufällig zu sein, und sie scheinen sich um Grenzen mit benachbarten Gruppen zu gruppieren. Was möchte ich untersuchen, ob Einzelpersonen in der Nähe einiger Gruppen mehr markieren als in der Nähe anderer? Markieren Einzelpersonen beispielsweise weniger nahe Gruppen, die eng miteinander verbunden sind? Ist es möglich zu zeigen, dass sich Punkte in der Nähe einiger Features gruppieren, aber nicht in der Nähe anderer?

Jede Hilfe, die zur Verfügung gestellt werden kann, wäre sehr dankbar,

Dave Humphries

##### Update

Zur Demonstration sehen Sie unten ein Bild von vier Gebieten (A, B, C und D) und die Markierungsorte von zwei Personen aus Gruppe A. Die Gruppen A und B sind eng miteinander verbunden. Die Gruppen C und D sind nicht mit Gruppe A verwandt.

Geben Sie hier die Bildbeschreibung ein

Dave Humphries
quelle
1
Können Sie Beispieldaten liefern?
om_henners
Entschuldigung, ich bin neu im Stack-Austausch - und GIS. Was ist das Standardformat für die Bereitstellung von Beispieldaten? ArcMap-Dokument?
Dave Humphries
1
Beispieldaten sollten in einem offenen GIS-Format veröffentlicht werden, das von vielen GIS-Systemen gelesen werden kann.
MarkusN
Einige der beteiligten Dateien sind Shapefiles, und so wie ich es verstehe, gibt es derzeit keine Möglichkeit, diese Dateitypen auf SE zu teilen. Ich freue mich, Beispiele per E-Mail an [email protected]
Dave Humphries
Eine andere Frage, während ich darüber nachdenke (Urlaub)): Werden die a-LoCoH-Grenzen aus demselben Markierungsdatensatz oder einem anderen Datensatz insgesamt erzeugt? Welche Art von Software verwenden Sie (und haben Sie Zugriff darauf)?
om_henners

Antworten:

1

Ich würde dringend empfehlen, sich R anzuschauen , insbesondere das Spatstat-Paket von CSRIO. Es gibt ein ausgezeichnetes Handbuch / Tutorial von Prof. Adrian Baddeley , das Sie durch eine Vielzahl verschiedener Methoden zur Punktmusteranalyse führt. Insbesondere würde ich mir Teil VII: Markierte Punktmuster ansehen (insbesondere die Markierungskorrelationsfunktion auf Seite 202). Hinweismarken beziehen sich hier auf Daten, die durch ein Attribut klassifiziert werden, anstatt eine numerische Beziehung zu haben.

Am Anfang des Dokuments befindet sich außerdem ein Kapitel zum Einlesen von Daten (mit rgdal , sp usw.). Wenn Sie ArcGIS verwenden ich einen Blick auf das nehmen würde Geospatial Modellierungsumgebung als eine Möglichkeit zur Verbindung zwischen Daten in R und ArcGIS, sonst QGIS hat Manager , die das gleiche tun.

Schließlich hat @whuber (unter vielen anderen) hier auf GIS SE eine Menge Erfahrung in R, also stellen Sie Fragen, wenn Sie sie finden, oder versuchen Sie, ihn im Chat zu packen.

om_henners
quelle
Vielen Dank für Ihre Vorschläge. Ich werde das Spatstat-Paket ausprobieren und sehen, wie es mir geht.
Dave Humphries