Ich bin ein Neuling in der Überlebensanalyse, obwohl ich einige Kenntnisse in Klassifikation und Regression habe.
Für die Regression haben wir MSE- und R-Quadrat-Statistiken. Aber wie können wir sagen, dass das Überlebensmodell A neben einigen grafischen Darstellungen (KM-Kurve) dem Überlebensmodell B überlegen ist?
Wenn möglich, erläutern Sie den Unterschied anhand eines Beispiels (z. B. Teilpaket in R). Wie können Sie zeigen, dass ein CART-Überlebensbaum besser ist als ein anderer CART-Überlebensbaum? Welche Metriken können verwendet werden?
regression
survival
goodness-of-fit
cart
rpart
Überflutung
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Antworten:
(Schließlich können Sie natürlich, wenn Sie einen bestimmten Zweck für die Modelle im Auge haben - das heißt, wenn Sie wissen, was Ihre Vorhersageverlustfunktion ist -, sie immer nach der Verlustfunktion bewerten! Aber ich vermute, Sie ' Ich bin nicht so glücklich ...)
Für eine eingehendere Diskussion sowohl der Likelihood-Ratio-Statistiken als auch von Harrells c sollten Sie sich Harrells hervorragende Lehrbuch- Regressionsmodellierungsstrategien ansehen . Der Abschnitt zur Bewertung von Überlebensmodellen ist §19.10, S. 492-493. Es tut mir leid, dass ich Ihnen keine endgültige Antwort geben kann, aber ich denke nicht, dass dies ein gelöstes Problem ist!
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Cox-Regressionen proportionaler Gefahren für Überlebensdaten können in vielerlei Hinsicht als Standardregressionen angesehen werden. Beispielsweise liefern Cox-Regressionen auch verbleibende Standardfehler und R-Quadrat-Statistiken. Siehe die
coxph
Funktion im R-survival
Paket. (Sie können sich KM-Kurven als nicht parametrische Analysen in Standardstatistiken vorstellen. Wie würden Sie einen nicht parametrischen Test in CART integrieren?) In der Praxis mit klinischen Daten sind die verbleibenden Standardfehler tendenziell hoch und die R-Quadrat-Werte niedrig in der Cox-Regression.Daher haben Standardregressionen und Cox-Regressionen ähnliche Anforderungen und Einschränkungen. Sie müssen überprüfen, ob die Daten den zugrunde liegenden Annahmen entsprechen, was in der Cox-Analyse auch die Annahme einschließt, dass die verglichenen Gefahren über die Zeit proportional sind. Sie müssen immer noch eine Überanpassung vermeiden und Ihr Modell validieren. Und so wie ich CART verstehe, werden Sie, obwohl ich es selbst nicht benutze, immer noch mit den Schwierigkeiten konfrontiert sein, die sich aus dem Vergleich nicht verschachtelter Modelle ergeben.
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rpart
und anderen R-Paketen und Code.