Ich installiere OpenMM gemäß den Installationsanweisungen im OpenMM-Benutzerhandbuch .
Info: Das Testen kann nicht abgeschlossen werden, da ich nur 62% der Testziele abgeschlossen habe. Siehe unten.
Problembeschreibung
make install(oder sudo make install) gibt die folgende Meldung aus:
(base) bcramer@schrodinger:~/build_openmm$ make install
[ 62%] Built target ApiWrappers
[ 62%] Built target OpenMM
..............etc..........
[ 62%] Built target TestSerializeDrudeLangevinIntegrator
make[2]: *** No rule to make target '/usr/lib/x86_64-linux-gnu/libnvrtc.so', needed by 'libOpenMMCudaCompiler.so'. Stop.
CMakeFiles/Makefile2:7253: recipe for target 'plugins/cudacompiler/CMakeFiles/OpenMMCudaCompiler.dir/all' failed
make[1]: *** [plugins/cudacompiler/CMakeFiles/OpenMMCudaCompiler.dir/all] Error 2
Makefile:140: recipe for target 'all' failed
make: *** [all] Error 2
Aufgrund des Fehlers habe ich Folgendes verwendet:
stat /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libnvrtc.so
stat: cannot stat '/usr/lib/x86_64-linux-gnu/libnvrtc.so': No such file or directory
Danach habe ich benutzt:
sudo apt-file search /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libnvrtc.so
Dies gab die Antwort:
libnvrtc9.1: /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libnvrtc.so.9.1
libnvrtc9.1: /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libnvrtc.so.9.1.85
nvidia-cuda-dev: /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libnvrtc.so
Als ich rannte
cd /usr/lib/x86_64-linux-gnu/
Die Datei libnvrtc.sowar im angegebenen Verzeichnis nicht vorhanden.
Ich habe den folgenden Pfad in die bashUmgebung aufgenommen, um Folgendes einzuschließen libnvrtc.so:
export LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/cuda-9.2/lib64/stubs:$LD_LIBRARY_PATH
export LD_LIBRARY_PATH=/usr/lib/x86_64-linux-gnu:$LD_LIBRARY_PATH
Die Datei libnvrtc.soist in vorhanden /usr/local/cuda-9.2/lib64.
Wenn ich stat /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libnvrtc.soerneut renne, erhalte ich weiterhin die Nachricht:
stat: cannot stat '/usr/lib/x86_64-linux-gnu/libnvrtc.so': No such file or directory
Frage: Wie kann ich dieses Problem lösen, damit es make installfunktioniert?