tmux veranlasst anaconda, eine andere Python-Quelle zu verwenden

Ok, ich bin in meiner Anaconda-Umgebung und habe welche Python ausgeführt. Ich bekomme

/home/comp/anaconda3/envs/env1/bin/python

Wenn ich nun tmux starte, dann starte aktiviere env1 und dann welche Python bekomme ich

/home/comp/anaconda3/bin/python

obwohl ich meine Umgebung aktiviert habe. Wie kann ich Anaconda dazu bringen, denselben Pfad in tmux zu sehen?

Die Lösung scheint darin zu bestehen, die Conda-Umgebung zu deaktivieren, dann tmux zu starten und dann die Umgebung innerhalb von tmux zu reaktivieren.

Dieses Verhalten wird durch TMux-Sourcing ~/.profileanstelle von verursacht ~/.bashrc. Mein ~/.profileist das:

# if running bash
if [ -n "$BASH_VERSION" ]; then
    # include .bashrc if it exists
    if [ -f "$HOME/.bashrc" ]; then
    . "$HOME/.bashrc"
    fi
fi

# set PATH so it includes user's private bin if it exists
if [ -d "$HOME/bin" ] ; then
    PATH="$HOME/bin:$PATH"
fi

# set PATH so it includes user's private bin if it exists
if [ -d "$HOME/.local/bin" ] ; then
    PATH="$HOME/.local/bin:$PATH"
fi

Sie können sehen , dass erste ~/.bashrc bezogen ist und dann ~/bin und ~/.local/binwerden vorangestellt . Wie ich selbst erlebt habe , führt dies condazu einem Hickup.

Die Lösung wäre, die beiden Blöcke zu kommentieren, in denen PATH manipuliert wird ~/.profile.

Bearbeiten (24.09.2019): Noch besser scheint es zu sein, TMux so zu konfigurieren, dass keine Login-Shell, sondern nur eine normale erzeugt wird. Siehe die Antworten für die verknüpfte Frage.

Laufen:

conda activate env1

Anstatt:

source activate env1

Als ich drinnen war, arbeitete tmux für mich.

Folgendes passiert mir nach dem Start einer Tmux-Sitzung (ohne dass conda eine aktive Umgebung hat).

Wenn ich es zum ersten Mal in der Tmux-Sitzung mache:

conda activate myEnv

Ich bekomme

CommandNotFoundError: Your shell has not been properly configured to use 'conda activate'.
To initialize your shell, run

    $ conda init <SHELL_NAME>

Currently supported shells are:
  - bash
  - fish
  - tcsh
  - xonsh
  - zsh
  - powershell

See 'conda init --help' for more information and options.

IMPORTANT: You may need to close and restart your shell after running 'conda init'.

Wenn ich stattdessen:

source deactivate
conda activate myEnv

Alles funktioniert gut. which pythonzeigt auf den richtigen Pfad.

Ich finde, dass tmux immer das Profil für Ihre Shell aufruft, nicht nur das rc. Wenn Sie also wie ich bash verwenden, wird / etc / profile aufgerufen, wodurch path_helper aufgerufen wird.

Um dies zu beheben, wechseln Sie /etc/profilezu:

if [[ -z $TMUX ]] && [ -x /usr/libexec/path_helper ]; then
        eval `/usr/libexec/path_helper -s`
fi

Wenn Sie bash verwenden, ändern auch alle export PATH=$PATH:/fooin .bashrczu

if [[ -z $TMUX ]]; then
  export PATH=$PATH:/foo
fi

Dann starten Sie das Terminal neu (zum Beispiel Iterm). Alles sollte gut sein!

nano ~/.bash_profile

Fügen Sie die folgenden Zeilen hinzu:

source deactivate env1
source activate env1

arbeitete für mich.