Meine Frage geht an diejenigen, die sich mit rechnergestützter Biologie befassen. Ich werde diesen Herbst einen Kurs über Bioinformatik belegen. Das Problem ist jedoch, dass ich zu wenig Hintergrundwissen in Biologie und Chemie habe, um mich auf diesen Zyklus von Lektionen vorbereitet zu fühlen (ich war in diesen Fächern in der Schule ziemlich schwach).
Könnten Sie Bücher empfehlen, die eine gute Einführung in die Fragen der Naturwissenschaften bieten, auf die sich die Bioinformatik konzentriert?
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Mikhail Dubov
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Antworten:
Wie bereits in einer früheren Antwort erwähnt, ist es nicht unbedingt erforderlich, dass Sie Biologie studieren, um Bioinformatik zu betreiben. Wenn Sie jedoch ein Hintergrundverständnis der grundlegenden Konzepte wie Gene, RNA, DNA usw. haben möchten, sollte ein gutes einführendes Biologiebuch alles bieten, was Sie benötigen.
Die Molekularbiologie ist jedoch nicht das Thema, in das man einfach eintauchen kann. Um dies zu verstehen, müssen Sie daher eine einführende Lektüre durchführen. Das beste Buch ist eines, das genug Details enthält, ohne davon auszugehen, dass Sie Biologe werden möchten.
Ich schlage vor, dass Sie sich Collins Outline of College Biology ansehen. Wenn Sie die Kapitel 2-5 und 12-15 lesen, erhalten Sie grundlegende Informationen, die Sie wünschen. Eine andere Wahl ist Schaums Outline of Biology, dritte Ausgabe, Kapitel 2-4 und 7-10. Beide Bücher kosten weniger als 20 US-Dollar und sind leicht zu verstehen. Hoffe das hilft.
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Als jemand, der aus der Informatik stammt und ein Team leitete, das ein Produkt mit Bioinformatik entwickelt, kann ich mit der Herausforderung sympathisieren, die Domäne zu übernehmen - aber es ist ein faszinierender Bereich, in dem man arbeiten kann.
Wie @JCEHR hervorgehoben hat, ist es nicht unbedingt erforderlich, Biologie zu studieren, aber es ist hilfreich, einige der Prinzipien zu erlernen. Bei der Bioinformatik geht es nicht nur um Molekularbiologie, Genomsequenzierung, Proteinexpression und Proteinstruktur (keine Sorge, wenn Sie diese Begriffe jetzt nicht verstehen), sondern ich bin ziemlich zuversichtlich, dass dies der Bereich ist, den die überwiegende Mehrheit der "traditionellen Bioinformatik" ausmacht. angewendet wird und wäre der Kern eines jeden Kurses zu diesem Thema. Eines der wichtigsten messbaren Merkmale von DNA, RNA und Protein ist, dass es sich um eine Folge von Molekülen handelt, die durch eine Software-Kette dargestellt werden können. Das Annotieren, Speichern und (Fuzzy-) Suchen dieser Strings sind Schlüsseltechniken.
Neben einer allgemeinen Biologie-Grundierung können Sie sich auch ein Buch ansehen, in dem es um Genomik geht. Folgendes sieht gut aus, ist aber ziemlich teuer:
Ein Primer der Genomwissenschaft von Greg Gibson und Spencer V. Muse
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Als Informatiker, der sein Nebenfach in Biochemie absolvierte, würde ich Larry Gonicks Cartoon-Leitfaden zur Genetik empfehlen .
Das ist kein Witz. Ich kenne mehrere angesehene Bioinformatiker, die auf diese Weise Genetik gelernt haben. Das Buch erklärt das meiste, was, wenn nicht alles, was Sie wissen müssen, und liefert die intuitivsten visuellen Elemente, um sich mit den zugrunde liegenden Konzepten zu beschäftigen. Und es macht Spaß zu lesen.
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Wie andere Ihnen gesagt haben: Es hängt ein wenig von dem Buch ab, das Sie verwenden werden, sowie von den Themen, die unterrichtet werden. Manchmal ist es ziemlich selbsterklärend. Um jedoch besser vorbereitet zu sein (und sich an die Terminologie zu gewöhnen), schauen Sie sich einige Primer im Internet an, wie Preparata: A Biology Primer for Computer Scientists .
Haben wir Kollegen oder ist die "Biostar" -Seite ein freundlicher Klon? Siehe die Frage: " Beste Ressourcen zum Erlernen der Molekularbiologie für einen Informatiker ".
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