Als «lme4-nlme» getaggte Fragen

In diesem Forum wird viel darüber diskutiert, wie verschiedene hierarchische Modelle richtig angegeben werden können lmer. Ich dachte, es wäre großartig, alle Informationen an einem Ort zu haben. Ein paar Fragen zum Starten: So legen Sie mehrere Ebenen fest, in denen eine Gruppe in der anderen...

Hier ist, wie ich verschachtelte vs. gekreuzte zufällige Effekte verstanden habe: Verschachtelte zufällige Effekte treten auf, wenn ein Faktor der unteren Ebene nur innerhalb einer bestimmten Ebene eines Faktors der oberen Ebene erscheint. Zum Beispiel Schüler in Klassen zu einem festgelegten...

Wenn wir einen Glimmer nachrüsten, erhalten wir möglicherweise eine Warnung, die uns mitteilt, dass das Modell Schwierigkeiten hat, sich anzunähern ... z >Warning message: In checkConv(attr(opt, "derivs"), opt$par, ctrl = control$checkConv, : Model failed to converge with max|grad| =...

Die Anpassung einer logistischen Regression mit lme4 endet mit Error in mer_finalize(ans) : Downdated X'X is not positive definite. Eine wahrscheinliche Ursache für diesen Fehler ist offenbar ein Rangmangel. Was ist ein Rangmangel und wie soll ich damit

Ich habe ein paar gemischten Effekte für Modelle (insbesondere Längs Modelle) mit lme4in Rmöchte aber wirklich um die Modelle beherrschen und den Code, der mit sich geht. Bevor ich jedoch mit beiden Beinen eintauche (und ein paar Bücher kaufe), möchte ich sicher sein, dass ich die richtige...

Ich benutze lme4 in R, um das gemischte Modell zu passen lmer(value~status+(1|experiment))) Wo Wert stetig ist, sind Status und Experiment Faktoren, und ich verstehe Linear mixed model fit by REML Formula: value ~ status + (1 | experiment) AIC BIC logLik deviance REMLdev 29.1 46.98 -9.548...

Kürzlich habe ich gemessen, wie die Bedeutung eines neuen Wortes bei wiederholten Expositionen (Praxis: Tag 1 bis Tag 10) durch Messen von ERPs (EEGs) ermittelt wird, wenn das Wort in verschiedenen Kontexten betrachtet wurde. Ich kontrollierte auch die Eigenschaften des Kontexts, zum Beispiel seine...

Ich frage mich, ob es einen Unterschied in der Interpretation macht, ob nur die abhängigen, sowohl die abhängigen als auch die unabhängigen Variablen oder nur die unabhängigen Variablen log-transformiert werden. Betrachten Sie den Fall von log(DV) = Intercept + B1*IV + Error Ich kann die IV als...

EDIT 2: Ursprünglich dachte ich, ich müsste eine Zweifaktor-ANOVA mit wiederholten Messungen für einen Faktor durchführen, aber jetzt denke ich, dass ein lineares Mischeffektmodell für meine Daten besser funktioniert. Ich glaube, ich weiß fast, was passieren muss, aber ich bin immer noch durch...

Numerisch die Ableitung MLE s von GLMM schwierig ist und in der Praxis, ich weiß, wir sollten nicht Brute - Force - Optimierung verwenden (zB mit optimauf einfache Art und Weise). Aus pädagogischen Gründen möchte ich es jedoch versuchen, um sicherzustellen, dass ich das Modell richtig verstehe...

Ich möchte ein Vorhersageintervall für eine Vorhersage aus einem lmer () -Modell erhalten. Ich habe eine Diskussion darüber gefunden: http://rstudio-pubs-static.s3.amazonaws.com/24365_2803ab8299934e888a60e7b16113f619.html http://glmm.wikidot.com/faq Sie scheinen jedoch die Unsicherheit der...

Effectspackage bietet eine sehr schnelle und bequeme Möglichkeit , lineare Mischeffekt-Modellergebnisse zu zeichnen, die mit lme4package erhalten wurden . Die effectFunktion berechnet Konfidenzintervalle (CIs) sehr schnell, aber wie vertrauenswürdig sind diese

Kürzlich wurde mir klar, dass ein gemischtes Modell mit nur einem Subjekt als Zufallsfaktor und den anderen Faktoren als festen Faktoren einer ANOVA entspricht, wenn die Korrelationsstruktur des gemischten Modells auf zusammengesetzte Symmetrie eingestellt wird. Daher möchte ich wissen, was...

Ich habe Daten aus einem Experiment gesammelt, das wie folgt organisiert ist: Zwei Standorte mit jeweils 30 Bäumen. 15 werden behandelt, 15 werden an jeder Stelle kontrolliert. Von jedem Baum nehmen wir drei Stängelstücke und drei Wurzelstücke, also 6 Proben der Stufe 1 pro Baum, die durch eine...

Ich versuche zu verstehen, wann ein zufälliger Effekt verwendet werden soll und wann er nicht erforderlich ist. Ich habe eine Faustregel erhalten, wenn Sie 4 oder mehr Gruppen / Individuen haben, die ich tue (15 einzelne Elche). Einige dieser Elche wurden zwei- oder dreimal für insgesamt 29...

Ich möchte ein mehrstufiges GLMM mit einer Poisson-Verteilung (mit Überdispersion) unter Verwendung von R ausrüsten. Im Moment verwende ich lme4, aber mir ist aufgefallen, dass die quasipoissonFamilie kürzlich entfernt wurde. Ich habe an anderer Stelle gesehen, dass Sie additive Überdispersion für...

Hoffentlich ist dies eine Frage, die mir hier jemand zur Art der Zerlegung von Quadratsummen aus einem Modell mit gemischten Effekten beantworten kann, das dazu passt lmer(aus dem Paket lme4 R). Zuallererst sollte ich sagen, dass mir die Kontroverse bei der Verwendung dieses Ansatzes bewusst ist,...

Ich habe mich gefragt, ob mich jemand über die aktuellen Unterschiede zwischen diesen beiden Funktionen aufklären könnte. Ich fand die folgende Frage: Wie wähle ich die Bibliothek nlme oder lme4 R für Modelle mit gemischten Effekten? , aber das stammt aus ein paar Jahren. Das ist ein Leben lang in...

Ich möchte einen p-Wert und eine Effektgröße einer unabhängigen kategorialen Variablen (mit mehreren Ebenen) erhalten - das ist "insgesamt" und nicht für jede Ebene separat, wie es die normale Ausgabe von lme4in R ist. Es ist genau wie das, was die Leute berichten, wenn sie eine ANOVA betreiben....

Welche praktischen und interpretationsbezogenen Auswirkungen hat das Schätzen in einem mehrstufigen Modell im Vergleich zum Nichtschätzen von Korrelationsparametern für zufällige Effekte? Der praktische Grund, dies zu erfragen, ist, dass es im früheren Framework in R keine implementierte Methode...