Als «efficiency» getaggte Fragen

Ich habe mehrere herausfordernde nicht konvexe globale Optimierungsprobleme zu lösen. Derzeit verwende ich die Optimization Toolbox von MATLAB (speziell fmincon()mit algorithm = 'sqp'), was sehr effektiv ist . Der größte Teil meines Codes ist jedoch in Python, und ich würde die Optimierung gerne...

Eines der Hauptprobleme, mit denen wir uns in molekularen Simulationen befassen müssen, ist die Berechnung von entfernungsabhängigen Kräften. Wenn wir die Kraft- und Abstandsfunktionen einschränken können, um gerade Potenzen des Abstandes , können wir einfach das Quadrat des Abstandes r 2 = r ⋅ r...

Meine Forschungsgruppe konzentriert sich auf die Molekulardynamik, die offensichtlich als Teil einer einzelnen Flugbahn Gigabyte an Daten erzeugen kann, die dann analysiert werden müssen. Einige der Probleme, mit denen wir uns befassen, betreffen Korrelationen im Datensatz. Dies bedeutet, dass wir...

Ich führe Molekulardynamik (MD) -Simulationen mit verschiedenen Softwarepaketen wie Gromacs und DL_POLY durch. Gromacs unterstützt jetzt sowohl den Partikelzerlegungs- als auch den Domänenzerlegungsalgorithmus . Standardmäßig verwenden Gromacs-Simulationen die Domänenzerlegung, obwohl bis vor...

Durch die automatische Unterscheidung können wir die Ableitung eines Programms für eine bestimmte Eingabe numerisch auswerten. Es gibt einen Satz, der besagt, dass diese Berechnung weniger als das Fünffache der Kosten für die Ausführung des ursprünglichen Programms kostet. Dieser Faktor fünf ist...

Ich bin daran interessiert, Berechnungen aufzustellen, um zu prüfen, ob ein Abstandskriterium erfüllt ist: Das heißt, der Abstand zwischen einem Vektor xixi{\bf x}_i und einem anderen Vektor xjxj{\bf x}_j sollte kleiner sein als ein Wert rmaxrmaxr_{\rm max} . Meine Daten sind nach einem...

Ich habe gelesen, dass, wenn ich zum Beispiel eine Doppelschleife habe for, die über die Indizes einer Matrix läuft, es effizienter ist, die Spalte, die den Index ausführt, in die äußere Schleife zu setzen. Beispielsweise: a=zeros(1000); for j=1:1000 for i=1:1000 a(i,j)=1; end end Was ist der...

Wie werden Spezialfunktionen mit doppelter Genauigkeit auf dem neuesten Stand der Technik implementiert? Ich brauche die folgende Integral: fürm=0,1,2,. . . undt>0, was als niedrigere unvollständige Gammafunktion geschrieben werden kann. Hier ist meine Fortran- und C-Implementierung:F.m( t ) =...

Ich versuche den Unterschied zwischen diesen beiden Grafikkarten für das akademische Rechnen zu verstehen, speziell für die DGEMM-Komponente. Wenn wir uns die Rohstatistik ansehen, haben beide den gleichen GK110-Chip, vergleichbare Statistiken in praktisch jeder Kategorie und, glaube ich, die...

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