Computational Science

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Sind DAXPY, DCOPY, DSCAL Overkills?

Ich habe CG in FORTRAN implementiert, indem ich es mit Intel MKL verknüpft habe. Wenn es Aussagen gibt wie: ( Siehe Wikipedia ) p=r; x=x+alpha*p r=r-alpha*Ap; oder ähnliche in QMR (in viel größerer Menge) v_tld = r; y = v_tld; rho = norm( y ); w_tld = r; z = w_tld; xi = norm( z ); (and more) Ist es...

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Molekulardynamische Simulation von Wasserdampf?

Ich versuche MD mit Wasserdampf zu machen. Wie ich weiß, gibt es einige Wassermodelle für flüssiges Wasser, wie SPC, SPC / E, TIP3P, aber gelten sie auch für den Dampfzustand von Wasser? Und was ist der Unterschied zwischen Simulationen von flüssigem und dampfförmigem

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Berechnen Sie die kleinsten Eigenvektoren einer Matrix

Es scheint, dass Matlab's eigsmir schlechte Annäherungen an die kleinsten Eigenvektoren einer Matrix gibt. Ich gehe davon aus, dass ich einige langsamere Methoden verwenden kann, die auch genauer wären ... Ich suche nach dem zweitkleinsten Eigenvektor einer Lapalcian-Matrix (bekannt als "Fiedler"...

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Können MPI-Nachrichten priorisiert werden?

Soweit ich weiß, stimmt die Reihenfolge, in der nicht blockierende Punkt-zu-Punkt-MPI-Nachrichten (Isend und Irecv) empfangen werden, mit der Reihenfolge überein, in der sie gesendet werden. Gibt es Techniken, um bestimmten Nachrichten Vorrang vor anderen zu geben? Zum Beispiel haben wir einen...

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Lösen nichtlinearer singulärer ODE mit SciPy-Odeint / ODEPACK

Ich möchte die Lane-Emden-Isothermengleichung lösen [PDF, Gl. 15.2.9] d2ψdξ2+2ξdψdξ=e−ψd2ψdξ2+2ξdψdξ=e−ψ\frac{d^2 \!\psi}{d \xi^2} + \frac{2}{\xi} \frac{d \psi}{d \xi} = e^{-\psi} mit den Anfangsbedingungen ψ(ξ=0)=0dψdξ∣∣∣ξ=0=0ψ(ξ=0)=0dψdξ|ξ=0=0\psi(\xi = 0) = 0 \quad \left.\frac{d\psi}{d...