Ein erwarteter Bruchteil abgelehnter Nullhypothesen, die fälschlicherweise abgelehnt werden, dh der Bruchteil signifikanter Befunde, die tatsächlich nicht wahr sind. Eine Methode zur Kontrolle des FDR in mehreren Tests ist das Benjamini-Hochberg-Verfahren.
Benjamini und Hochberg entwickelten die erste (und meines Erachtens immer noch am weitesten verbreitete) Methode zur Kontrolle der Falschentdeckungsrate (FDR). Ich möchte mit einer Reihe von P-Werten beginnen, von denen jeder für einen anderen Vergleich dient, und entscheiden, welche niedrig genug...
In meinem Statistikprogramm werden sowohl die Verfahren Benjamini & Hochberg (1995) als auch Benjamini & Yekutieli (2001) für die Falschentdeckungsrate (FDR) implementiert. Ich habe mein Bestes getan, um die spätere Abhandlung durchzulesen, aber sie ist ziemlich mathematisch dicht und ich...
Ich habe versucht, mir Gedanken darüber zu machen, wie die False Discovery Rate (FDR) die Schlussfolgerungen des einzelnen Forschers beeinflussen sollte. Sollten Sie zum Beispiel Ihre Ergebnisse bei diskontieren, selbst wenn sie bei signifikant sind ? Hinweis: Ich spreche vom FDR im Zusammenhang...
Wir wissen, dass wir Benjamini-Hochberg-ähnliche Korrekturen für Mehrfachhypothesentests auf Experimente anwenden müssen, die auf einem einzigen Datensatz basieren, um die Rate falscher Entdeckungen zu kontrollieren. Andernfalls könnten alle Experimente, die ein positives Ergebnis liefern, falsch...
Diese Frage wurde schon einmal hier und hier gestellt, aber ich glaube nicht, dass die Antworten die Frage direkt ansprechen. Haben unzureichende Studien die Wahrscheinlichkeit von Fehlalarmen erhöht? Einige Nachrichtenartikel machen diese Behauptung. Zum Beispiel : Geringe statistische...
Das folgende Zitat stammt aus dem berühmten Forschungsbericht Statistical Meaning für genomweite Studien von Storey & Tibshirani (2003): Zum Beispiel bedeutet eine falsch-positive Rate von 5%, dass im Durchschnitt 5% der wirklich null Merkmale in der Studie als signifikant bezeichnet werden....
Ich habe diesen großartigen Artikel von David Colquhoun gelesen: Eine Untersuchung der Rate falscher Entdeckungen und der Fehlinterpretation von p-Werten (2014). Im Wesentlichen erklärt er, warum die Rate falscher Entdeckungen (FDR) bis zu betragen kann, obwohl wir den Fehler vom Typ I mit...
Sowohl in der Literatur zur familienbezogenen Fehlerrate (FWER) als auch zur Falschentdeckungsrate (FDR) gelten bestimmte Methoden zur Steuerung von FWER oder FDR als geeignet für abhängige oder unabhängige Tests. Zum Beispiel schrieb Holm 1979 in dem Aufsatz "Ein einfaches sequentiell rejektives...
Ich habe gelesen, dass die Kontrolle von FDR weniger streng ist als die Kontrolle von FWER, wie in Wikipedia : FDR-Steuerverfahren üben eine weniger strenge Kontrolle über falsche Entdeckungen aus als FWER-Verfahren (Familywise Error Rate) (wie die Bonferroni-Korrektur). Dies erhöht die Leistung...
Permutationstests (auch Randomisierungstest, Re-Randomisierungstest oder exakter Test genannt) sind sehr nützlich und nützlich, wenn die zum Beispiel erforderliche Annahme einer Normalverteilung t-testnicht erfüllt ist und wenn die Transformation der Werte durch Rangfolge der Werte erfolgt Ein...
Ich verstehe das Verfahren und was es steuert. Wie lautet also die Formel für den angepassten p-Wert in der BH-Prozedur für Mehrfachvergleiche? In diesem Moment wurde mir klar, dass das ursprüngliche BH keine angepassten p-Werte produziert, sondern nur die (nicht-) Ablehnungsbedingung angepasst...
Gibt es eine einfache Möglichkeit zu erklären, warum das Verfahren von Benjamini und Hochberg (1995) tatsächlich die Rate falscher Entdeckungen (FDR) kontrolliert? Dieses Verfahren ist so elegant und kompakt, und dennoch ist der Beweis, warum es in der Unabhängigkeit funktioniert (siehe Anhang...
Kann jemand erklären, wie FDR-Verfahren einen FDR ohne ein Modell / eine Annahme der Basisrate von echten Positiven schätzen können?
Ich habe eine dreidimensionale Tabelle der Größe . Jede Zelle der Tabelle ist ein Hypothesentest. Das Schneiden der Tabelle in der dritten Dimension erzeugt Sätze von Hypothesentests, die zwischen Sätzen unabhängig, aber innerhalb von Sätzen abhängig sind. Ursprünglich dachte ich, ich könnte die...
Ich habe einen Datensatz, in dem ich auf signifikante Unterschiede zwischen drei Populationen in Bezug auf etwa 50 verschiedene Variablen teste. Ich mache dies einerseits mit Kruskal-Wallis-Tests und andererseits mit Likelihood-Ratio-Tests für verschachtelte GLM-Modellanpassungen (mit und ohne...
Eine etwas seltsame Frage. In meinem heutigen Biostatistikkurs im vierten Jahr diskutierten wir, wann und wann keine Mehrfachtestkorrektur angewendet werden sollte, und der Professor machte einen spontanen Kommentar. Er fragte, warum wir nicht jeden Test korrigieren, den wir jemals durchgeführt...
In http://surveyanalysis.org/wiki/Multiple_Comparisons_(Post_Hoc_Testing) heißt es Wenn wir beispielsweise einen p-Wert von 0,05 haben und daraus schließen, dass er signifikant ist, beträgt die Wahrscheinlichkeit einer falschen Entdeckung per Definition 0,05. Meine Frage: Ich habe immer gedacht,...
Die Falschentdeckungsrate (Benjamini-Hochberg) wird normalerweise für "Big Data" verwendet, z. B. für genetische Studien mit Hunderten von Tests. Aber kann es auch bei einer geringeren Anzahl von Tests verwendet werden? Betrachten Sie beispielsweise die Ergebnisse von zwei Gruppen (Männer gegen...
Ich habe 350 unabhängige Tests durchgeführt. Ich muss sie für die mehrfachen Vergleiche korrigieren. Ich verwende das Benjamini-Hochberg (BH) -Verfahren zur Kontrolle des FDR. Die vorherige Auswahl des Q (der Ebene, auf der wir den FDR steuern möchten) könnte jedoch einschränkend sein (z. B. finde...
Ich habe einen Datensatz mit einer kleinen Anzahl von Stichproben und einer großen Anzahl von Variablen. Ich habe für jede Variable einen Hypothesentest (T-Test) durchgeführt und eine Reihe von p-Werten erhalten. Die Variablen sind jedoch miteinander korreliert und die FDR-Korrektur...